Yale Üniversitesindeki el yazmaları kütüphanesinde bulunan geniş bilgi deposunun ortasında garip bitkiler ve astronomik semboller ile çıplak kadın resimleriyle resimlendirilmiş bir orta çağ el yazması bulunmaktadır. Tek sorun bu kitabın 200 sayfalık gösterişli metninin bilinmeyen bir dilde olması ve tüm çabalara rağmen bu metnin deşifre edilememesidir...
Bu şaşırtıcı kitaba, onu 1912de İtalya Frascati'deki Jesuit kolejinin kütüphanesinden alan New York'lu kitapçı Wilfred M. Voynich'in adı verilmiştir. El yazmasının içinde, Jesuit'in ünlü öğretim görevlisi Athanasius Kircher'a eski öğretmeni Marcus Marci tarafından yazılmış bir mektup bulunmuştur. Mektupta Marci, el yazmasının eski sahiplerinden biri olan Roma imparatoru II. Rudolph'un kitabın yazarının, 13. yy'da yaşamış İngiliz bilim adamı/simyacı Roger Bacon olduğunu iddia ettiğini yazmıştır.
Voynich el yazmasını aldıktan sonra aralarında savaş zamanında şifre çözümü için işe alınanlar ve eski dil araştırmacıları da olmak üzere dünyanın önde gelen şifre çözücüleri için kopyalar hazırladı ancak hiçbirinin elinden birşey gelmedi. Sadece dil anlaşılmaz olmakla kalmıyor aynı zamanda kitapta çizimleri yer alan bitkiler dünyada bulunmuyordu!!
Kitabın sırlarını biraz olsun aydınlığa kavuşturmuş tek kişi Yale Üniversitesi profesörlerinden Robert S. Brumbaugh'tur. O bunun simyaya dair bir çalışma olduğunu ileri sürmüştür. Bu tür çalışmalar ayrıntılı sembolizmi ve gizli metinleriyle dikkat çekmektedir. El yazmasının kenar boşluğunda karalanmış hesaplamalar sayesinde Brumbaugh bir kod oluşturmuş ve gerçekte de var olan bazı çiçeklerin ve yıldızların isimlerini deşifre etmeyi başarmıştır. Bunun dışında metnin içeriği hala bir gizem olarak kalmaktadır...